Notícia

Ferramenta de realidade virtual para ser usada no combate a doenças

Pesquisadores da Universidade Lund, na Suécia, revolucionaram a forma como grandes quantidades de dados de células são analisados usando tecnologia de videogame 3D

Divulgação, CellexalVR

Fonte

Universidade Lund

Data

sábado, 27 novembro 2021 06:50

Áreas

Big Data. Bioinformática. Biologia. Realidade Virtual.

A ciência tem a tecnologia para medir a atividade de cada gene em uma única célula individual, e apenas um experimento pode gerar milhares de dados de células. Pesquisadores da Universidade Lund, na Suécia, revolucionaram a forma como esses dados são analisados ​​- usando a tecnologia de videogame 3D. O estudo foi publicado na revista científica iScience.

Técnicas avançadas de sequenciamento de DNA e RNA abriram a possibilidade de estudar células individuais em tecidos de uma forma mais abrangente do que era possível anteriormente. O grande desafio dessas técnicas de sequenciamento é que elas geram grandes quantidades de dados.

“Quando você quer distinguir células cancerosas de células normais, por exemplo, é necessário examinar milhares de células para obter um entendimento adequado, o que se traduz em enormes quantidades de dados numéricos”, disse o Dr. Shamit Soneji, pesquisador em Biologia Computacional da Universidade Lund.

Para tornar esses dados compreensíveis, cada célula é matematicamente posicionada no espaço tridimensional para formar um “roteiro” das células e como elas se relacionam entre si. No entanto, esses mapas podem ser difíceis de navegar usando um computador desktop normal. “Ser capaz de analisar seus próprios dados e manipulá-los de forma intuitiva e eficiente proporciona um entendimento totalmente novo. Na verdade, eu diria que em Realidade Virtual se pensa de forma diferente, graças à capacidade da técnica de envolver seu corpo no processo de análise ”, explicou o Dr. Mattias Wallergård, pesquisador em Design de Interação e Realidade Virtual na Universidade Lund.

A equipe de pesquisa desenvolveu o software CellexalVR: um ambiente de realidade virtual que permite aos pesquisadores usar ferramentas intuitivas para explorar todos os seus dados em um só lugar. Mapas 3D de células que foram calculadas a partir da atividade do gene e outras informações capturadas de células individuais podem ser exibidos, e o pesquisador pode ver claramente quais genes estão ativos quando certos tipos de células são formados.

Usando um óculos de Realidade Virtual, o usuário tem um universo completo de populações de células à sua frente e pode determinar com mais precisão como as células se relacionam umas com as outras. Usando dois controladores manuais, eles podem selecionar células de interesse para análise posterior com gestos simples como se fossem objetos físicos.

Assista ao vídeo de apresentação da tecnologia (em inglês):

Como o espaço não é problema, é possível ter vários mapas celulares na mesma ‘sala’ e compará-los lado a lado, o que é difícil em uma tela de computador tradicional. Os pesquisadores também podem se encontrar neste mundo da RV para analisar dados juntos, apesar de estarem em lugares diferentes geograficamente.

“Mesmo que você não esteja familiarizado com programação de computadores, esse tipo de análise está aberto a todos. Um mundo virtual é uma área de pesquisa em rápido desenvolvimento e com enorme potencial para cientistas que precisam acessar e processar big data de forma mais interativa e colaborativa ”, concluiu o Dr. Shamit Soneji.

O software pode ser baixado gratuitamente.

Acesse o software CellexalVR.

Acesse o artigo científico completo (em inglês).

Acesse a notícia na página da Universidade Lund (em inglês).

Fonte: Universidade Lund. Imagem: Divulgação, CellexalVR.

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